独立以来，肯盟长期一党执政，1991年12月肯改行多党制后，又连获1992年和1997年两次多党选举胜利，莫伊蝉联总统。

2003年，肯新政府将根除腐败和振兴经济作为施政要务，推行一系列社会经济改革，政局保持基本稳定。1月15日，政府公布三项法案《肯尼亚宪法修正法案》、《反腐败和经济犯罪法案》和《国家公职人员职业道德准则法案》，后两项法案于4月份经议会审议通过正式生效。

肯尼亚实行总统制。内阁由总统、副总统、各部部长和总检察长共26人组成。